Д-р Сале Алсекх

Ръководител на отдел “Количествена генетика на културните растения”, Център по растителна системна биология и биотехнология, Пловдив, България.

Професионален опит

• HEAD OF DEPARTMENT “CROP QUANTITIVE GENETICS”
  Center of Plant Systems Biology and Biotechnology
  (2023 – present)

• PROJECT LEADER
  Max-Planck-Institute for Molecular Plant Physiology
  (2019 – 2022)

• POSTDOCTORAL RESEARCHER
  Max-Planck-Institute for Molecular Plant Physiology
  (2015 – 2019)

• PhD STUDENT
  Max-Planck-Institute for Molecular Plant Physiology
  (2011 – 2015)

• RESEARCHER
  Hebron University, West Bank-Palestine
  (2007 – 2011)

Образование и степени

• PhD / MOLECULAR PLANT PHYSIOLOGY
  Max-Planck-Institute for Molecular Plant Physiology and Potsdam University, Germany (2015)

• MSc. / NATURAL RESOURCES & SUSTAINABLE MANAGEMENT SCIENCES
  Hebron University, Hebron, Palestine (2007)

• BSc. / SCIENCE, BIOLOGY DEPARTMENT
  Hebron University, Hebron, Palestine (2002)

Резюме

Над 140 публикации в международни рецензирани списания, 23 като първи или съавтор, шест като автор-кореспондент или съавтор. Над 3500 цитирания (h-индекс: 33, Google Scholar). Няколко поканени изказвания на национални или международни конференции и научни семинари. През последните години проведох GWAS и QTL картиране при домати, царевица и други растителни видове. В допълнение към картографирането на QTL имам няколкогодишен опит в метаболитното профилиране (използвайки както GC-MS, така и LC-MS). Основните ми интереси са: подобряване на културите, хранително качество, опитомяване и селекция на растенията.

Преподавателска дейност и ръководство на студенти

• LECTURER IN FUNCTIONAL GENOMICS
  Potsdam University (± 22h/year)
  2018, 2019, 2020, 2021

• CO-SUPERVISION
  Four PhD students and two Master students
  2018

Награди

JEFF-SCHELL-PRIZE, 2015
Max Planck Institute of Molecular plant physiology, Germany

Избрани Публикации:

Alamillo JM, López CM, Martínez Rivas FJ, Torralbo F, Bulut M, Alseekh S (2023) Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein and hairy roots: a perfect match for gene functional analysis and crop improvement. Curr Opin Biotechnol. 79: 102876.

Fernie AR, Alseekh S (2022) Metabolomic selection-based machine learning improves fruit taste prediction. Proc Natl Acad Sci USA 119(9): e2201078119. doi: 10.1073/pnas.2201078119.

Fernie, A.R., and Alseekh, S. (2022). Unravelling the molecular networks that regulate kiwifruit flavor. The New Phytologist 233, 8-10.

Aarabi, F., Rakpenthai, A., Barahimipour, R., Gorka, M., Alseekh, S., Zhang, Y., Salem, M.A., Brückner, F., Omranian, N., Watanabe, M., Nikoloski, Z., Giavalisco, P., Tohge, T., Graf, A., Fernie, A.R., and Hoefgen, R. (2021). Sulfur deficiency-induced genes affect seed protein accumulation and composition under sulfate deprivation. Plant Physiology 187, 2419-2434.

Aksenov. A.A., Laponogov., I…. Alseekh S., Fernie A.R., Mirnezami R., Vasiliou V., Schmid R., Borisov R.S., Kulikova L.N., Knight R., Wang M., Hanna G.B., Dorrestein P.C., and Veselkov, K. (2021). Auto-deconvolution and molecular networking of gas chromatography-mass spectrometry data. Nature Biotechnology 39, 169-173.

Alseekh S., Aharoni A., Brotman Y., Contrepois K., D’Auria J., Ewald C.J., Ewald J., Fraser P.D., Giavalisco P., Hall R.D., Heinemann M., Link H., Luo J., Neumann S., Nielsen J., Leonardo Souza P., Saito K., Sauer U., Schroeder C.F., Schuster S., Siuzdak, G., Skirycz A., Sumner W.L., Snyder P.M., Tang H., Tohge T., Wang Y., Wen W., Wu S., Xu G., Nicola Zamboni N., R. Fernie A.R. (2021) Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices. Nature Methods. 18: 747–756.

Alseekh. S., and Mohammad, A.G. (2009). The effect of water harvesting techniques on runoff, sedimentation, and soil properties. Environmental management. 44, 37-45.